QRコードを、携帯電話では読み取ることができても、QRコードリーダーで読み取れない場合があるのですが

回答

【対象環境】ApeosWare Flow Service QRコードリーダー 

「QRコードリーダー」と「携帯電話に付属のQRコード読み取り機能」ではQRコードの読み取り方式の特徴として以下のような違いがあります。

●QRコード画像の取得回数について
「携帯電話に付属のQRコード読み取り機能」では、画像を撮影しながらQRコードの読み取りを行なえるため、読み取れる条件のQRコード画像が得られるまで複数回画像を取得することが可能です。
一方、「QRコードリーダー」では、スキャンされたただ1つの画像に対して読み取りを行なうので、QRコードの読み取りに失敗した場合にも画像の再取得が行なえません。QRコード画像を再取得するには、再度スキャンなどを実施していただく必要があります。

●印刷サイズと取得できるQRコード画像のサイズについて
「携帯電話に付属のQRコード読み取り機能」では、QRコードの印刷サイズが比較的小さい場合でもカメラを接近させて撮影することで、読み取り可能なサイズのQRコード画像を取得可能になります。
一方、「QRコードリーダー」では、スキャンされた原稿全体からQRコードを探索するため、QRコードの印刷サイズ、読み取り時の解像度設定が推奨値を満たしていない場合にはQRコードを読み取れない場合があります。