再インストールしても、以前使用していた設定が残っています。

回答

【対象環境】Document Reader 1.0 

再インストールしたユーザーは、初期の設定になりますが、それ以外のユーザーは、再インストール前の設定が残ります。
初期設定に戻す場合、[仕様設定]画面から[標準に戻す]を実行してください。