ジョブ履歴を自動配信するように設定していますが、次の自動配信の日時の前に手動でジョブ履歴を取得すると、次の自動配信時のジョブ履歴には、手動で取得したジョブの履歴が含まれなくなりますか？

手動で取得したジョブの履歴が抜けることはありません。手動でジョブ履歴を取得しても、自動配信時には前回の自動配信後のジョブ履歴から配信されます。